《山东科技大学学报（自然科学版）》(原名《山东矿业学院学报》)，1979年9月创刊，双月刊。《学报（自然科学版）》以为教学科研服务，向国内外展示宣传学校科研成果和综合学术实力为己任，坚持立足科大、开放办刊的宗旨，严格执行国家及国际标准，紧密结合学校教学、科研和学术交流实际，《学报（自然科学版）》设矿业工程、地球科学、土木建筑、机电工程、化工与环境、材料科学与工程等栏目，刊登校内外相关领域的重大科研理论成果和学术前沿研究论文。
　　 《学报（自然科学版）》严格执行国家关于出版工作的方针、政策、法律和法规，严格审查制度，严格执行编辑规范，精心策划，使学报学术水平和整体质量不断提高，赢得了良好的社会声誉，产生了积极的社会影响，多次受到上级主管部门的表彰和奖励：1996、2000、2004、2009年4次在山东省自然科学技术期刊质量评估中，获得 “优秀级期刊”称号；2000年12月，获首届《CAJ-CD检索与评价数据规范》“执行优秀奖”；2006年10月获教育部科学技术司“首届中国高等学校特色期刊奖”；2008年10月，学报编辑部获中国高校自然科学学报研究会 “高校科技期刊先进集体”称号；2008年11月，被中国期刊协会评为首届期刊 “编校无差错承诺活动”合格刊社；2009年11月，获中国高校自然科学学报研究会“全国高校科技期刊优秀编辑质量奖”。
　　 根据2009年11月的统计，《学报 （自然科学版）》进入俄罗斯《文摘杂志》（AJ）、美国《化学文摘(网络版)》（CA（Web））、美国《剑桥科学文摘》（CSA，被23种文摘列入来源期刊表）等5家国际重要数据库；在国内数据库方面，《学报（自然科学版）》是《中国学术期刊综合评价数据库》来源期刊、《中国学术期刊（光盘版）》暨《中国期刊网》全文收录期刊、万方数据（chinaInfo）系统科技期刊群入网期刊、中国科学院文献情报中心《中国数学文摘》定期摘引刊物、煤炭科技信息所《中国煤炭数字图书馆》收录期刊。